Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGAP3Q9NP61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms