Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE7BQ9NP56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE7BQ9NP56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7BQ9NP56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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