Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNAJC4Q9NNZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC4Q9NNZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJC4Q9NNZ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms