Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCC2Q9HCC0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCC2Q9HCC0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms