Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC24A3Q9HC58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC24A3Q9HC58 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A3Q9HC58 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms