Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX8Q9HC52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX8Q9HC52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms