Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ELP3Q9H9T3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ELP3Q9H9T3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ELP3Q9H9T3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms