Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD3Q9H7B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD3Q9H7B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD3Q9H7B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms