Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
REEP4Q9H6H4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
REEP4Q9H6H4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms