Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF41Q9H4P4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF41Q9H4P4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms