Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHD1Q9H4M9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms