Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC42EP4Q9H3Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42EP4Q9H3Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42EP4Q9H3Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms