Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00597Q9H2U6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms