Protein–RNA interactions for Protein: Q9H257

CARD9, Caspase recruitment domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD9Q9H257 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD9Q9H257 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD9Q9H257 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARD9Q9H257 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms