Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ9H0N0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ9H0N0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB6CQ9H0N0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ9H0N0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ9H0N0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ9H0N0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms