Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD1Q9GZZ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD1Q9GZZ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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