Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDGFDQ9GZP0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDGFDQ9GZP0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDGFDQ9GZP0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms