Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNTNAP4Q9C0A0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNTNAP4Q9C0A0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNTNAP4Q9C0A0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CNTNAP4Q9C0A0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms