Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRRCC1Q9C099 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRCC1Q9C099 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRCC1Q9C099 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms