Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM5Q9C035 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms