Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NMES1Q9C002 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NMES1Q9C002 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms