Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM8Q9BZR9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM8Q9BZR9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms