Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDEM3Q9BZQ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms