Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms