Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP5Q9BXF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms