Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC94Q9BW85 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC94Q9BW85 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC94Q9BW85 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms