Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOOQ9BVL4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOOQ9BVL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOOQ9BVL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOOQ9BVL4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SELENOOQ9BVL4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOOQ9BVL4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms