Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSRP1Q9BUV0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms