Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms