Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFAF3Q9BU61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms