Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTA3Q9BTC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTA3Q9BTC8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms