Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RTKNQ9BST9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms