Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2Q9BSQ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCM2Q9BSQ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms