Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TINF2Q9BSI4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TINF2Q9BSI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TINF2Q9BSI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms