Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2orf88Q9BSF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms