Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIKE1Q9BRV8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIKE1Q9BRV8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms