Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOK1Q9BRS2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RIOK1Q9BRS2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOK1Q9BRS2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms