Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC3Q9BQ90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms