Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYSTQ99698 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms