Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP4Q99569 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP4Q99569 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms