Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP88Q99567 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP88Q99567 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP88Q99567 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms