Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGMNQ99538 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGMNQ99538 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms