Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UHRF1Q96T88 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UHRF1Q96T88 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms