Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNKPQ96T60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNKPQ96T60 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms