Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RSF1Q96T23 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
RSF1Q96T23 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
RSF1Q96T23 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
RSF1Q96T23 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms