Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN18Q96SJ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms