Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UIMC1Q96RL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UIMC1Q96RL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms