Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CICQ96RK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms