Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TEFMQ96QE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TEFMQ96QE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms