Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPDC7Q96QD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPDC7Q96QD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms